本院的「神學系」有兩類的課程,分別為在現有的三個神學課程基礎上,增設三個主修「神學系」的學位;分別為「神學學士主修神學系」(Bachelor major in Theological Studies)、「神學研究碩士主修神學系」(Master of Theological Studies major in Theological Studies)及「道學碩士主修神學系」(Master of Divinity major in Theological Studies),旨在裝備神學學位課程之同時,讓學員在基督信仰上更加進深學習,並在理性上作出整全的反思,期望能能建立健全神學思維,以回應當代生活與文化挑戰的信徒。
另外,為渴望在信仰上扎根而又能進深反思信仰的人士,本院亦設有「神學系證書課程」來滿足他們的需要,為關注這方面的人士提供學習的機會。
