本院的「聖經系」有三類的課程，分別為「神學研究碩士主修新約研究」(Master of Theological Studies Major in New Testament Studies)、「神學研究碩士主修舊約研究」(Master of Theological Studies Major in Old Testament Studies)及「道學碩士主修聖經系」(Master of Divinity major in Biblical Studies)。
另外，為有心志在聖經上學習的人士，本院亦有設辦「聖經系證書課程」(Diploma in Biblical Studies) 來滿足他們的需要，為關注這方面的人士提供學習的機會。
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「神學研究碩士主修新約研究」
(Master of Theological Studies Major in New Testament Studies)
合共 20 科＋專題論文 或 2 科自選科目 66 學分 |
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共同核心課程：共 7 科，21 學分 |
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| 0000 神學治學法 | 1001 聖經解釋入門 | 1100 新約概論 |
| 1200 舊約概論 | 2000 神學研究導引 | 2200 教會歷史縱論 |
| 3000 實踐神學導論 | ||
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聖經主修科目：共 7 科，21 學分，必修科目3 科，自選科目4 科 |
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必修科目 3 科，9 學分 |
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| 5101 新約希臘文 (一) | 5102 新約希臘文 (二) | 115X 新約專題研究 | |||
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自選科目 4 科，12 學分，在以下各個科目中選讀 3 科新約，1科舊約 |
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| 新約科目 | 舊約科目 |
|---|---|
| 1112 馬可福音（粵語、普通話） 1126 腓立比書（粵語、普通話） 1142 雅各書（粵語、普通話） 1143 從哥林多前書看活在兩個世代中的衝突（粵語、普通話-字幕版） 1124 加拉太書（粵語、普通話） |
1210五經研究（粵語、普通話） 1211 創世記（普通話） 1212 出埃及記（普通話） 1214 民數記（普通話） 1231 詩篇研究（普通話） 1236 詩歌智慧書選讀（粵語） 1227 阿摩司書（粵語） 1228 以賽亞書（粵語） 5201 舊約希伯來文(一) （普通話） |
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聖經科目：共 2 科，6 學分 |
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| 1002 釋經學 | 1003 聖經批判學與聖經詮釋 [碩] (** 必須先完成 1002 **) |
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神學及歷史科目：共 2 科，6 學分 |
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| 2110 上帝、創造與終末 | 2210 早期及中古教會史 |
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實踐科目：共 2 科，6 學分 |
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| 3200 實用輔導法 | 另自選1科 |
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自選科目 (在下列兩項中選一項)：共 6 學分 |
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1. 為要在不同課題上有更多的認識，可選任何科目：自選 2 科，6 學分 或 2. 為要加強在研究方面的訓練，可選專題論文(相等於兩科)： 6 學分 |
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「神學研究碩士主修舊約研究」
(Master of Theological Studies Major in Old Testament Studies)
合共 20 科＋專題論文 或 2 科自選科目 66 學分 |
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共同核心課程：共 7 科，21 學分 |
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| 0000 神學治學法 | 1001 聖經解釋入門 | 1100 新約概論 |
| 1200 舊約概論 | 2000 神學研究導引 | 2200 教會歷史縱論 |
| 3000 實踐神學導論 | ||
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聖經主修科目：共 7 科，21 學分，必修科目3 科，自選科目4 科 |
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必修科目 3 科，9 學分 |
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| 5201 舊約希伯來文 (一) | 5202 舊約希伯來文 (二) | 125X 舊約專題研究 | |||
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自選科目 4 科，12 學分，在以下各個科目中選讀 1 科新約，3科舊約 |
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| 新約科目 | 舊約科目 |
|---|---|
| 1112 馬可福音（粵語、普通話） 1126 腓立比書（粵語、普通話） 1142 雅各書（粵語、普通話） 1143 從哥林多前書看活在兩個世代中的衝突（粵語、普通話-字幕版） 5101 新約希臘文(一) （粵語、普通話） |
1210 五經研究（粵語、普通話） 1211 創世記（普通話） 1212 出埃及記（普通話） 1214 民數記（普通話） 1231 詩篇研究（普通話） 1236 詩歌智慧書選讀（粵語） 1227 阿摩司書（粵語） 1228 以賽亞書（粵語） |
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聖經科目：共 2 科，6 學分 |
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| 1002 釋經學 | 1003 聖經批判學與聖經詮釋 [碩] (** 必須先完成 1002 **) |
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神學及歷史科目：共 2 科，6 學分 |
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| 2110 上帝、創造與終末 | 2210 早期及中古教會史 |
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實踐科目：共 2 科，6 學分 |
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| 3200 實用輔導法 | 另自選1科 |
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自選科目 (在下列兩項中選一項)：共 6 學分 |
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1. 為要在不同課題上有更多的認識，可選任何科目：自選 2 科，6 學分 或 2. 為要加強在研究方面的訓練，可選專題論文(相等於兩科)： 6 學分 |
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「道學碩士主修聖經系」
(Master of Divinity Major in Biblical Studies)
合共 30 科＋3 科實習項目 99 學分 |
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共同核心課程：共 7 科，21 學分 |
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| 0000 神學治學法 | 1001 聖經解釋入門 | 1100 新約概論 |
| 1200 舊約概論 | 2000 神學研究導引 | 2200 教會歷史縱論 |
| 3000 實踐神學導論 | ||
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聖經主修科目：從下列新約和舊約科目中自選，共3 科，9 學分 |
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| 新約科目 | 舊約科目 |
|---|---|
| 1112 馬可福音（粵語、普通話） 1126 腓立比書（粵語、普通話） 1142 雅各書（粵語、普通話） 1143 從哥林多前書看活在兩個世代中的衝突（粵語、普通話-字幕版） |
1210 五經研究（粵語、普通話） 1211 創世記（普通話） 1212 出埃及記（普通話） 1214 民數記（普通話） 1231 詩篇研究（普通話） 1236 詩歌智慧書選讀（粵語） 1227 阿摩司書（粵語） 1228 以賽亞書（粵語） |
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自選科目 (在下列兩項中選一項)：共 6 學分 |
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5101 新約希臘文(一) 及 5102 新約希臘文(二) 或 5201 舊約希伯來文(一) 及 5202 舊約希伯來文(二) |
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聖經科目：共 6 科，18 學分 |
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| 1002 釋經學 | 115X 新約專題研究(碩) | 另自選2科 |
| 1003 聖經批判學與聖經詮釋(碩) | 125X 舊約專題研究(碩) | |
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神學及歷史科目：共 6 科，18 學分 |
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| 2001 歷史研究導引(碩) | 2240 中國教會史 | 另自選 3 科 |
| 2110 上帝、創造與終末 | ||
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實踐科目：共 6 科，18 學分 |
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| 3100 教牧學概論 | 3140 行政管理與教會 | 另自選 2 科 |
| 3110 實用講道法 | 3200 實用輔導法 | |
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實習項目：共 3 科，9 學分 |
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| 3401 實習教育(一) | 3402 實習教育(二) | 3403 實習教育(三) |
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「聖經系證書課程」(Diploma in Biblical Studies) 合共 10 科 30 學分 可選擇學士或碩士級別 |
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共同核心課程：共 3 科，9 學分 |
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| 0000 神學治學法 | 1100 新約概論 | 1200 舊約概論 |
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聖經系科目：共7 科，21 學分，必修科目 2 科，自選科目 5 科 |
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必修科目 2 科，6 學分 |
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| 1001 聖經解釋入門：上文下理釋經法（粵語、普通話） | 1002 釋經學（粵語、普通話） | |
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自選科目 5 科，15 學分 在以下科目中按「2 科新約+3科舊約」或「3 科新約+2科舊約」的組合選修 |
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| 新約科目 | 舊約科目 | |
|---|---|---|
| 1100 新約概論（粵語、普通話） 1112 馬可福音（粵語、普通話） 1126 腓立比書（粵語、普通話） 1142 雅各書（粵語、普通話） 1143 從哥林多前書看活在兩個世代中的衝突（粵語、普通話-字幕版） 1153 新約專題研讀(碩士)：羅馬書研讀—保羅神學的處境性與實用性（粵語、普通話） 5101 新約希臘文(一) （粵語、普通話） 5102 新約希臘文(二) （粵語、普通話） |
1200 舊約概論（粵語、普通話） 1210 五經研究（粵語、普通話） 1211 創世記（普通話） 1212 出埃及記（普通話） 1214 民數記（普通話） 1231 詩篇研究（普通話） 1236 詩歌智慧書選讀（粵語） 1227 阿摩司書（粵語） 1228 以賽亞書（粵語） 5201 舊約希伯來文(一) （普通話） 5202 舊約希伯來文(二) （普通話） |
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