本院的「牧職培育系」有兩類的課程，分別為在現有的三個神學課程基礎上，增設三個主修牧職培育系的學位；分別為「神學士主修牧職培育」(Bachelor major in Pastoral Training)、「神學研究碩士主修牧職培育」(Master of Theological Studies major in Pastoral Training)及「道學碩士主修牧職培育」(Master of Divinity major in Pastoral Training)，旨在裝備神學學位課程之同時，能增強學員在基督教會或福音機構等環境中有效地從事牧職的事奉；我們所提供的學術訓練與實務應用具有聖經、神學，社會科學，以致文化的堅實基礎。
另外，為有心志在牧職的事奉上專注學習的人士，本院亦設有「牧職培育證書課程」來滿足他們的需要，為關注這方面的人士提供學習的機會。
